2016年吉隆坡世乒赛日本直通赛已经结束，松平健太拿下男乒直通卡，女乒方面，日本新秀平野美宇在直通赛首轮就不敌森樱出局，而拿下2015年瑞典公开赛U21女单冠军和2015年乒联总决赛U21女单亚军的浜本由惟夺得本次日本女乒2016世乒赛直通卡。
日本乒协2015年的官方文件中指出，2016世界乒乓球团体锦标赛入选标准：里约奥运报名选手直接入选，全国锦标赛冠军入选，直通选拔冠军入选，如满足上述条件者不足5人，则日本乒协召开会议讨论决定推荐名额，选手的国际竞争力是主要参考标准。
根据日本队2016年里约奥运会参赛名单，福原爱、石川佳纯与伊藤美诚均已入选2016世乒赛参赛名单，浜本由惟拿下2016世乒赛直通卡之后，日本女乒2016世乒赛出战席位仅剩一人，第五人名额需等待日本乒协给出最后决定。
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